美国新冠病例猛增，奥密克戎新变异株占半壁江山(2)

　　新闻延伸

　　BA.2.12.1刺突蛋白上的L452Q突变

　　根据进化树分析，BA.2.12.1的出现时间应该是2021年末到2022年初，出现地点大概率是美国，截至4月全球上传的BA.2.12.1序列97%来自美国。

　　要理解BA.2.12.1出现L452Q意味着什么，首先得了解刺突蛋白。刺突蛋白，是新冠病毒与人体细胞受体结合并进入宿主细胞的重要结构。由于刺突蛋白也是中和抗体和T细胞针对的对象，因此刺突蛋白受到的正向选择压力格外大，变异频繁。

　　刺突蛋白共有1273个氨基酸位点，由相对中间的681位点将其分为S1和S2两个亚基。S1亚基由N端结构域和受体结构域（receptor-binding domain， RBD）构成，S2亚基由融合肽（FP）、内部融合肽（IFP）及两个七肽重复区组成。

　　新冠病毒颗粒通过刺突蛋白的S1亚基RBD结构域与ACE2受体结合后锚定在人体细胞上。细胞上的跨膜丝氨酸蛋白酶2（transmembrane protease serine 2，TMPRSS2）能够激活新冠病毒入侵细胞。在TMPRSS2作用下S1亚基被切割，暴露出S2亚基中的FP，启动膜融合并进一步将病毒释放到宿主细胞中。随后病毒ssRNA附着在核糖体上进行复制和蛋白的翻译并进一步的加工包装成新的病毒，在释放后造成感染的扩散与宿主细胞的损伤并激活免疫系统。

　　考虑到受体结构域（RBD，319至537之间）是刺突蛋白与ACE2受体结合的区域，这部分的突变可能影响免疫逃逸能力和受体亲和能力，因此这部分的突变格外受到病毒学家的关注。452位点便位于受体结构域（RBD）。

　　如果说452指的是刺突蛋白的位置，那么两个字母L和Q指的是相应的氨基酸。蛋白质由20种氨基酸构成，其中L指的是突变前的氨基酸是亮氨酸，R代表了突变后的氨基酸类型是谷氨酰胺。L452Q的完整意思就是刺突蛋白位点452的亮氨酸突变成了谷氨酰胺。

　　奥密克戎席卷全球的浪潮可分为两部分：BA.1主导前期，之后BA.2迅速取代前者。病毒学家Stegger等人的研究发现BA.2能够重新感染新近从BA.1感染中康复的患者，因为BA.2拥有几个关键突变，使其有别于BA.1谱系，包括T191、L24S、A25/27、V213G、T376A和R408S。而这些关键突变使得全球新冠感染者飙升。

　　而近期，BA.2谱系下BA.2.12.1则正在续写BA.2取代BA.1的剧本。BA.2.12.1是Pango命名法下的名称。Pango命名前面的英文字母代表属于某一个支系，后面的点和数字代表来源于前面支系的第几个子代分支。BA.2.12.1意味着其为奥密克戎谱系第2分支下的第12个子分支下的第1个孙分支。